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海南医学院和海口经济学院两所学校都位于海口市，属于同城高校，但是两所学校距离比较远。虽然两所学校都是“学院派”，但是两所学校的差别比较大，海南医学院是一所公办高校，而海口经济学院是一所民办学校。

海南医学院，属于海南省老牌高校，解放前就已经成立的一所医学类学校。这所学校建国之后改为卫校，是一所中专学校，当时主要是培养基层医疗人员的学校，整体实力虽然不强，但是确实为海南的卫生医疗事业做出了巨大贡献。“大跃进”时期，以这所学校为基础创办了海南医学专科学校，但是三年困难时期，又将其降为中专学校了。不过，此后虽然办学较为坎坷，但是一直持续教研工作。

上个世纪八十年代初期，海南并未建省，当时还是广东省海南行政区建制，属于省下属最高级行政单位，根据当时的高校配置要求，也需要建立一所属于海南的高校，所以年开始筹建海南大学。不过，海南高等教育资源相对匮乏，早期中专学校也比较少，只能通过合并海南师专、海南医专、海南农院组建了海南大学，由此，成为海南大学医学院。

年撤销了广东省海南行政区，该设为海南省和海南经济特区，而根据高教要求，省一级单位又需要医学高校，为此又将海南大学医学院独立建制发展至今。总体来看，海南医学院的实力完胜海口经济学院，毕竟海南医学院是一所公办高校，而且办学更早，相对经验更为丰富一些。